功能性灭绝是指该物种因其生存环境被破坏，数量非常稀少，以致在自然状态下基本丧失了维持繁殖的能力，甚至丧失了维持生存的能力。功能性灭绝是物种灭绝的先兆，如不及时抢救，该物种的灭绝危在旦夕。有时也可以理解为功能性灭绝就意味着物种的灭绝。

功能性灭绝一般是指，虽然理论上仍不排除有少量活体存在，但残存种群中已经没有能够繁殖的个体，抑或由于数量过于稀少，已低于一种生物存在和繁衍的最低限度，最终灭绝只是时间早晚的问题。功能性灭绝是从物种种群的功能层面，对其生存状况所下的一个定义，表明某物种在自然状态下丧失了繁衍功能和生态功能，随时可能灭绝。